Funkcjonowanie unii celnej wymaga od państw członkowskich stosowania jedno­litych regulacji prawa celnego dla całego obszaru gospodarczego objętego wspól­nymi zasadami obrotu towarowego z zagranicą. Stawia to istotne wyzwania dla wszystkich administracji celnych realizujących politykę celną w ramach unii celnej. Działania państw członkowskich powinny w tym zakresie umożliwiać prawidłowy rozwój gospodarczy oraz wysoki poziom ochrony interesów społecznych i gospo­darczych ugrupowania integracyjnego. Zależności te powodują konieczność koor­dynacji działań administracji regulujących obrót towarowy z zagranicą w poszcze­gólnych państwach członkowskich unii celnej. W Unii Europejskiej konieczność koordynacji działań w ramach funkcjonowania całego systemu celnego stała się podstawą gruntownej reformy regulacji prawnych określających ustrojowy, materialno­prawny i proceduralny model funkcjonowania unii celnej. Wdrażane zmiany legis­lacyjne mają na celu reformę informatyczną zapewniającą integrację rozwiązań informatycznych służących administrowaniu obrotem towarowym z zagranicą oraz powołanie nowych podmiotów administrujących mających zapewnić właściwą koordynację działań w ramach systemu celnego Unii Europejskiej.